Хранение информации в ДНК

Я слежу за основными новостями, происходящими в науке, но молекулярная биология (биохимия) и генетика сейчас на переднем краю прогресса и развиваются гораздо быстрее чем я мог себе представить. Давно слышал про возможность использования ДНК для хранению любой информации. Молекулы ДНК могут быть очень длинными и достаточно стабильными при определённых условиях, а каждый элемент молекулы ДНК — это один из четырёх нуклеотидов. Получается, что в теории каждая цепочка может хранить два бита.

Читал, что есть уже попытки чтения и записи информации в ДНК. Я думал, ну записывают пару десятков байтов. Но оказывается сейчас исследователи из Европейского института биоинформатики записали и надёжно прочитали 739 килобайт! Это 750 тысяч байт или шесть миллионов бит информации! В эти 739 килобайт входили все сонеты шекспира, JPG картинка и несколько текстовых документов.

Статья на habrahabr: http://habrahabr.ru/post/166889/

Пишут, что до этого проблемы были с стабильностью молекул, т.к. исследователи использовали все 4 типа нуклеотида, а при возникновении некоторых длинных одинаковых последовательностей в молекуле, она теряет стабильность. В последнем исследовании, учёные использовали только 3 нуклеотида, а четвёртый использовали для “сервисных” целей — как разделитель  для повышения стабильности.

Кстати схожая система чтения с компакт дисков. Данные там записаны в виде бугорков и их отсутствия, а если идёт подряд три или больше пустых мест, лазер может потерять дорожку и чтение прерывается. Для этого 8 бит информации кодируются в 12, где не может быть больше чем двух дырок подряд. Плюс для предотвращения единичных ошибок используется код Рида-Соломона. Думаю, ничего не мешает использовать подобную систему для записи информации в ДНК.

Ещё интересна стоимость записи и чтения информации. На данный момент стоимость записи одного мегабайта составляет 12 тысяч долларов, а чтение двести. С другой стороны, стоимость секвентирования ДНК (чтения) за последние десять лет уменьшилась на порядки и стоит ожидать через десяток лет коммерческие системы хранения информации в ДНК, ведь один грамм ДНК может хранить больше 2 петабайт информации…

P.s. Мой старый пост, про видео визуализации, что происходит в клетке: http://www.kushnerov.com/2009/06/02/chto-proisxodit-vnutri-kletki/

Mega

Создатели почившей файлопомойки megaupload.com открыли новый сервис Mega — https://mega.co.nz. Файлопомоек разных много, но новый сервис, что интересно, позиционируется как облачное хранилище файлов и даёт со старта аж 50 гигабайт свободного места забесплатно. За несколько дней популярность сайта стала больше чем даже dropbox.com, одного из популярных облачных хранилищ файлов.

mega-chart

Сайт явно не был готов к такой безумной популярности и поэтому работает не очень стабильно, а закачка не очень быстра, также есть вопросы к безопасности (файлы шифруются на стороне клиента). Хотя уже сейчас проект можно использовать как удобную файлопомойку (никакой рекламы пока нет) поддерживающую большие объёмы.

Но важно вот что, если создатели Mega решат основные проблемы, такой крупный игрок поменяет правила игры и вызовет новый виток конкуренции, что может привести к уменьшению цен и увеличению бесплатного места у всех игроков на рынке облачных хранилищ.

Я, например, использую Google Drive как хранилище документов (из-за Google Docs) и “облачную” флешку. Вот тут хотелось бы чуть больше бесплатного места чем 4 гигабайта 😉 А для “тяжёлого” бэкапа использую Crashplan за 3$ бакса в месяц, если платить за 2 года — там у меня забэкаплено больше 120 гигайбайт.

Ремонт наушников самостоятельно

Есть у меня мониторные наушники — Panasonic RP-DJ600. Наушники реально клёвые, с отличными басами, особенно для моего медведь-на-ухо-наступил слуха. Им уже два с половиной года — за это время подстёрлись надписи, одна гайка крепления дужки отваливается раз в неделю, подушечки покусал сын и один раз пришлось их склеивать супер-клеем, но они всё равно работают отлично и хорошо прилегают у ушам.

И вот на одно ухо звук стал доходить с перебоями, а потом и совсем пропал. Я уже начал искать новые наушники, но потом решил разобрать эти и попробовать их починить.

Оказалось всё просто. Когда звук начал пропадать, было ясно что провод переломался прямо в месте его вхождения в “ухо”, т.к. можно было подёргать провод и звук иногда кратковременно появлялся. Наверное второе место, где провод может переломаться — около разъёма “мини-джек”.

Ремонт наушников самостоятельно

Для начала я отсоединил “уши” от дужки и снял с него подушечку. Под подушечкой оказались два болта, которые соединяют две половинки “уха”.

Ремонт наушников самостоятельно

Внутри всё просто — динамик и провод к нему припаянный. Чтобы провод нельзя было выдернуть, он специально в одном месте завязан в узелок. Провод свободно выходит из “уха” через небольшую резиновую трубку, мне почему-то казалось, что он там намертво запаян.

Ремонт наушников самостоятельно

Я отрезал провод где то на сантиметр ниже точки выхода из “уха”.

Ремонт наушников самостоятельно

Затем очистил провод от изоляции и завязал новый узелок. Нужно это делать до того как припаивать провод к динамику, а не так как я в первый раз, сначала припаял, а потом задумался как делать узелок 😉

Нитка самого провода, кстати, очень тоненькая но многожильная, наверное, чтобы не так просто было его переломать.

Ремонт наушников самостоятельно

Второй динамик тоже пришлось разобрать, т.к. у меня провода от двух “ух” потом сливаются в один провод и чтобы эти два участка провода до соединения были одинаковой длины, нужно было укорачивать второй провод тоже. Тут я поступил просто — отпаял провод от динамика и завязал внутри второй узелок, чтобы внешние части провода были одинаковы, а затем припоял обратно.

Наушники Panasonic RP-DJ600

Вот и всё — теперь, надеюсь, наушники ещё поработают, как минимум, год.

Перестало хватать скорости ADSL

Ещё год назад казалось, что скорости интернета через ADSL хватит навсегда. У меня 10 мегабит скачка и 1,5 мегабит закачка. А вот сегодня этого уже совсем не хватает. Нужно на днях залить быстро 600 мегабайтный файл, а с этой скоростью он закачивался почти час. И файлы с торрентов, иногда хочется качать быстрее чем один мегабайт в секунду.

И проблема в том, что это практически максимум для интернета через телефонный кабель. Есть новые версии ADSL, где скачка до 25 мегабит, но аплоад всё равно не превышает 1,5 мегабита. Получается, что единственная альтернатива ждать пока провайдер затянет Ethernet в дом, а потом каким-то образом тянуть кабель через всю квартиру к компьютеру.

Amazon EC2 – Типы инстансов и цены

В продолжение поста про Amazon Elastic Compute Cloud (EC2) хостинг.

Есть несколько типов инстансов (виртуальных машин для запуска).

m1.small
1.7 Гб – оперативной памяти
1 EC2 юнит процессора
160 Гб диска
Базовая цена: $0.065 в час (~47,5$ в месяц)

m1.medium
3,75 Гб – оперативной памяти
2 EC2 юнита процессора
410 Гб диска
Базовая цена: $0.130 в час (~95$ в месяц)

m1.large
7.5 Гб – оперативной памяти
2 процессора по 2 EC2 юнита каждый
850 Гб диска
Базовая цена: $0.260 в час (190$ в месяц)

Read more